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【2022大创招募】徐鹏课题组——基于深度学习算法的大黄鱼"内脏白点病"感染表型测定

时间:2022/07/05

来源:徐鹏课题组

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课题简介:

由变形假单胞菌引起的“内脏白点病”是大黄鱼养殖中的重要病害,具有极高的感染率和死亡率,对养殖产业构成重大威胁。目前我们已经将基因组技术运用在选育工作中,并取得了初步成效,但是目前我们还是采用感染后“死亡-存活”二分类性状以及“死亡时间”作为抗性测评标准,反映的是大黄鱼在感染后的耐受性指标。为了更加精确的表征大黄鱼“内脏白点病”的抗性指标,我们引入深度学习((DL, Deep Learning)算法对脾脏“感染程度”表型进行标准化的测定。通过对大黄鱼自然群体进行标准化的人工感染,收集感染高峰期的脾脏感染高质量图片,并利用深度学习算法进行评估以确定每条大黄鱼的感染程度,进一步优化我们的抗性表型标准化测量体系,以提高基因组选择育种的预测准确性。

 

招募人数:2人

专业:海洋生物学

任务要求:感染表型标注及分析工作

联系人:徐鹏老师,xupeng77@xmu.edu.cn


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